后秦的领导班子全部被投进监狱，长安城里只剩下居民六万多户，王镇恶在城中大力宣扬东晋政府的恩德，加以安抚，局面渐渐稳定下来。
417年9月，刘裕终于如愿抵达长安，王镇恶赶紧到灞上迎接，刘裕满脸欣慰地对他说：“今天能完成这项霸主大业，全仰仗你啊。”
王镇恶连忙叩头说：“全是依靠明公的神威和各将领的努力，我有什么功劳。”
刘裕满意得笑了出来，一把扶起他，结伴向长安城走去。
这次会面貌似和谐，实则暗藏杀机——当然是刘裕对王镇恶的杀机。
原本顺利攻克长安，刘裕应该欢喜非常，但中间的插曲让他感觉很不好，那就是王镇恶不听号令，在后秦境内横冲直撞。
刘裕的控制欲极强，这次北伐必定要完全掌控局面，虽处在后方，但对于前线的战略战术安排，其实早有交待，部将们只允许有小幅度的自由发挥。
但王镇恶显然就发挥过头了，在他决定跨过洛阳西上的那一刻，就已经触怒了刘裕。
不久之后，王镇恶被困于潼关，派使节向刘裕求援，刘裕那时的情绪比较复杂，既恼怒，又得意，恼怒的是王镇恶不听号令，使前锋部队陷入危难，得意的则是王镇恶不听号令，果然把部队引入危难。
虽是同一件事，但刘裕的出发点却有两个，一是从大局考虑，一是从个人威望着想，大局来说，王镇恶偏离预定路线，主帅当然会生气，但从个人威望而言，王镇恶的失利最能说明刘裕的见识深远，正因王镇恶不听刘裕的安排，才使军队面临危机。
因为王镇恶统率的军队并不多，即便不幸失陷，刘裕也不会过分惋惜，反倒对自己的威望更加重视。
也正是这个缘故，当刘裕拒绝援救，已准备弃子的情况下，王镇恶居然绝地逢生，并最终夺得首功，无疑狠狠地打了刘裕一巴掌。
刘裕一贯的风格就是，你们都听我的，保证旗开得胜，如果敢不听从，失败是必然的，后果自负。
但王镇恶竟然打破这一常规，瞬间成为东晋最耀眼的明星，不但让同行的其他将领黯然失色，更让刘裕尴尬不已。
除此之外，关中人民一向敬重王猛，而东晋北伐兵团最终攻克长安、驱除羌贼，立下首功的又是王猛的孙子，所以百姓对他尤其推崇，满大街都在传扬王镇恶的传奇事迹，因此同行的原籍江南的将领无不嫉恨恼怒，心中感到不平。
刘裕更加不满意，按他的预期，当他走在长安城的街道上，两边一定挂满了赞扬自己的横幅标语，结果耳闻目睹的却全是王镇恶的那点破事，甚至都把王猛从坟里扒了出来，加以五花八门的吹捧庆祝。
前前后后这许多事，刘裕说什么也不能对王镇恶心生好感，只因王镇恶功高卓著，又不好公开对他表示厌恶，只能暂时隐忍不发，寻找机会发泄内心的愤恨。
这时候王镇恶不等刘裕公然发难，自己先沉沦了，随着鲜花和掌声从四面涌来，贪婪的一面也随之暴露，接管后秦国库时，把里面的金银财宝收入囊中，为数之多，无法计算。
刘裕大感激动，如果他低调行事，还真不好抓到小辫子，现在可好，主动送上门来了。
但贪财也不足以治罪，毕竟人为财死，爱财爱色都是人之常情，为了增强说服力，刘裕还需要有更加强有力的证据。
左右部属很快呈上好消息，经过连日的观察，发现王镇恶居然私藏了姚泓的御用辇车，居心不明。
刘裕大喜过望，如果消息属实，足可以给王镇恶安一个大逆不道的罪名，然后通过正常的法律程序将其除掉。
然而进一步的取证结果，让刘裕大跌眼镜，原来王镇恶只是喜欢辇车上的金银装饰，把宝贝剔取之后，顺手就把辇车抛到城外去了。
贪财到如此地步，也确实让人不服气都不行。
刘裕终于暂时放弃了诛杀王镇恶的念头，开始着手姚泓投降后的各项事务：从宫中收集的彝器（皇家祭庙用具）、浑天仪、土圭（测日仪器）、记里鼓（车有两层，行至一里下层敲鼓，行至十里，上层敲鼓）、以及指南车，全都运往建康皇宫，其他的金银璧玉、布匹绸缎、稀世珍宝全都赏赐给将士，用心犒赏三军。
对于秦帝姚泓，刘裕毫不犹豫地把他送到建康，绑赴刑场斩首。
以此之前，后秦平原公姚璞、并州督导官尹昭，献出蒲阪投降，东平公姚赞率姚家皇族一百多人，也向刘裕请降，刘裕同样二话不说就把他们全都处死。
和这段历史上的许多前辈相比，刘裕打定主意不走寻常路，别人攻灭敌国之后，一般都把敌国元首和一些名臣带到自己国内，给他们一些闲职，用以安抚，即便准备杀之而后快，往往也要等过个一年半载再做打算，而他则毫不客气地立即斩杀，彻底杜绝后患。
也许他是吸取了其他政权的教训，唯恐把定时炸弹带到国内，但更大的可能则是单纯的性格使然。
细数刘裕这些年的敌人，孙恩、桓玄、卢循、谯纵、慕容超、刘毅，除了孙恩尸骨无存，其他几人全被砍了脑袋。
好像只有当看到敌人身首异处，才能获得真正的胜利，得到真正的满足。
他这种凶暴的脾气很好地遗传给了下一代，为此，刘氏后人付出了血的代价。
处理完姚家的事，刘裕打算迁都洛阳，使国家重心回归，然后逐步恢复华夏。
高级军事参议官王仲德对此并不看好，劝阻他说：“不平凡的事，固然不是平凡的人能办到的，现在迁都倒也并不是空中楼阁，可是一旦宣布迁都，势必在江南引起大片骚动，不利国家稳定，而且大军在外已经很久，士卒都思念家乡，迁都这么大的事，还是不要讨论为妙。”
刘裕只得放弃这个念头，可又不想立刻回军，总觉得应该再做点什么，心里才踏实。当放眼北顾，胡夏和北魏的军事实力都不容小觑，短期内并无把握克敌制胜，当向西望去，凉州也许是不错的去处。
但就在他踌躇的时候，建康传来消息，顿时让所有计划都搁浅了。
渐入佳境
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